1988年7月，关东地区使用新型炸弹进行爆破，第三次世界大战即刻爆发。31年后，人类从一片废墟中重建都市，东京湾上建立了巨大城市——新东京。世界仿佛要恢复到以前的繁荣。 　　2019年的一个夜晚，新东京郊外的封闭高速公路上，暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年，是一名叫做金 田的职业高中学生。 　　突然，街上出现了一位奇怪的矮个子男子，暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时，军队驾驶直升飞机赶到。将那位矮个男子与铁雄一起收押。 　　铁雄进入了一个陌生的地方，这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道，他们的未来，因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。

大学三年级的川倉晴香（新木优子 饰）在好友浜崎真希（冈本杏理 饰）的推荐下参加了一家企业的实习生招募说明会。在听完企业CEO牧野正幸的演讲后，晴香对这个实习岗位并不感兴趣，正考虑放弃时，真希却帮她提交了申请。在回家的路上，晴香险些遇到了一场交通事故，而这时牧野及时出手救了她。 　　在床上醒来的牧野发现自己遇到了一个自称死神的人（佐野岳 饰），他还看到了自己灵魂出窍的情景。死神告诉他，由于他救了本应因交通事故而死的晴香，他的命运因此改变，变成了要代替晴香死去。为了让两人都能活下去，唯一的方法就是改变晴香的未来。于是，牧野决定附身在真希身上，全力支援晴香的实习生活。然而，晴香对于牧野的支持并不领情，她坚持要凭借自己的力量，却在实习期表现糟糕。