老校长森衣恭一（尾形一成 饰）在妻子去世之后过着离群索居的生活，个性古板而又顽固的他将自己的全部精力都投入到了俄罗斯文学的翻译工作之中。唯一还在和恭一走动的，除了经常给他带来各种资料的社工小鹿祥吾（染谷将太 饰）外，就只有一只可爱的小猫咪了。 　　这只小猫是恭一的太太生前喂养的流浪猫，它每天都会准时准点的出现在恭一家的院子里，于是恭一接替了太太的工作，成为了小猫的下一任“铲屎官”。某日，恭一发现小猫已经好几天没有出现了，对小猫已经产生了很深厚的感情的他决定走出家门，踏上寻找小猫的旅途。

在7年前在煤矿深处发现了不明身份的怪物的乡下小镇，疫病的传言流传开来，在心脏病患者新增的过程中，修验道者的年轻人贤一失踪了。贤一是活生生的木乃伊，为了拯救这个世界而进行的终极修行，就变成了神佛。然后，贤一醒过来说：“祓除被妖怪附身的世界。”

第二次世界大战的最后几个月，22岁的小野田宽郎被征召入伍，并在日本军事学校接受了游击战斗与情报训练。他的训练与传统武士道并不符合，就在被派遣到菲律宾卢邦岛作战时，他唯一接到的命令就是“绝对不准自杀”，无论发生任何状况、都要努力活下去。 　　小野田登岛后的第一项任务，就是摧毁卢邦岛 的机场和码头，反制试图降落的美军战机。但这项任务却告失败，美军的攻击迫使小野田与队友一路撤退，并躲进丛林之中。然而战争竟然很快就结束了。当日本投降消息不断传来，却都被小野田及队友们视为欺骗战术。 　　他们一行人躲在丛林里，以香蕉皮、椰子和偷来的米粮充饥。即使身处蛇虫鼠蚁之间，也绝不因为饥饿而投降。就算日本搜索队找到了他们，也都被认为是诱降的伎俩。小野田一心坚信，他正在执行一项秘密任务，就是要在皇军重返之前控制该岛，他并深信战争从未结束。

「屋根裏のラジャー」は、エミリー・グラヴェットが絵を担当したA・F・ハロルドによる小説「ぼくが消えないうちに」を原作とするファンタジー。愛を失った少女と、彼女が生み出した“誰にも見えない少年”ラジャーが想像と現実の世界を駆けめぐるさまが描かれる。