故事背景为日本的江户时代，风是一家小茶馆的侍女，这天茶馆里来了一群地方恶霸，其中地方官儿子龙次郎尤其欺人太甚。风因为意外得罪了龙次郎，情急之下，茶馆内一名无职浪人“无幻”出手救了风。另一方面，地方官正在欺压老百姓，流浪武士“仁”路见不平拔剑相助，杀死了地方官身边的四个“高手”保镖，救下了穷人，因此得罪了地方官。 　　随后，无幻和仁在茶馆里相遇并交手，忽然一场大火将他们困住，二人随之被捕。因儿子在大火中丧生，恼羞成怒的地方官勒令将二人砍首。砍首之日二人大闹刑场，并且在风的帮助下，从刑场中逃出来了。作为代价，风要求他们一起去寻找一个身上“带着向日葵香味”的武士。从此，三人展开了一场奇幻的旅程。 　　《混沌武士》由渡边信一郎监督，全片彰显了独特的浮世绘加现代Hip-Hop风格。本动画获选为2004年第八回日本文部省文化厅媒体艺术祭动画部门推荐的作品。

这是一个黑白颠倒欲望横行的罪恶时代，贫富差距的急剧增大直接导致了罪恶和仇恨的火种开始暗自燃烧。在六木本俱乐部中有着一个关于“女神”的传说，传说中，只要得到了女神的祝福，便能够实现所想的愿望。前战地摄影师雑贺辰己（高田裕司 配音）正在调查一宗议员谋杀案，误打误撞之中，他得到了女神——少女天王洲神乐（斉藤圭 配音）的吻，当他因拍下了女神容貌而被追杀的时候，辰己发现自己奇迹般的拥有了不死之身，而手中的相机，似乎也有了如同武器一般的强大威力。 　　长久以来，神乐都遭受着母亲天王洲神泉（高岛雅罗 配音）的虐待，成为女神，更是由于被催眠之故。于是，辰己带着神乐，利用自己“写杀”的异能力，开始了一段惊险而又刺激的逃亡之旅。

Two scientists are attempting to distribute the cure for a demon virus that is affecting people all over Japan, however, things have become complicated. One of them has become infected. So begins his battle with himself, as he attempts to not only control his emerging demon side, but also to save the lives of others by wielding its great strength. 　　--------------------------------------------- 　　原作：細野不二彦「バイオ・ハンター」（スコラ刊） 　　制作：山本又一郎、丸山正雄、高橋尚子 　　脚本：川尻善昭 　　絵コンテ：佐藤雄三 　　キャラクターデザイン・作画監督：浜崎博嗣 　　美術監督：番野雅好 　　撮影監督：山口仁 　　音響監督：本田保則 　　音楽：天野正道 　　--------------------------------------------- 　　出演： 　　駒田　関俊彦 　　越谷　井上和彦 　　さやか　皆口裕子 　　多部　石田太郎 　　ト堂　大塚周夫 　　美川　大友龍三郎 　　真理絵　五十嵐麗 　　ボス　島香裕 　　警官　中村大樹 　　上司　室園丈裕 　　ＯＬ　大塚瑞恵 　　手下　宮崎一成 　　--------------------------------------------- 　　作画監督補佐：田崎聡 　　原画：野田卓雄、新留俊哉、平田かほる、山沢実 　　箕輪豊、小池健、寺岡賢司、田崎聡、加野晃 　　春日井浩之、林秀夫、高秀国男、長濱博史、沖村幸治、高橋しんや 　　入江泰浩、鈴木典光、上田健一 　　川尻善昭 　　動画チェック：坂本豊、本山修、酒井博美 　　大島明子、坂詰かよ、望月頼子、尾沢直志 　　動画：小林理、渡辺佐紀、山田勝哉、根津直良、佐々木昌彦、真野鈴子 　　D.R.ムービー、京江動画、ウォンバット、亜細亜堂、イマジン、ジュニオ、トランスアーツ 　　色指定：三笠修、橋本賢 　　特殊効果：谷藤薫児 　　仕上検査：山本智子、大戸佐智子、角本百合子、林亜揮子 　　仕上：D.R.ムービー、スタジオ・オーエム、京江動画、LEEプロ、福島友子 　　背景：遠藤和茂、加藤幸子、河野羚、斉藤久恵、石川山子 　　撮影：斉藤敦郎、崎谷祐樹、小口修二 　　トランスアーツ 　　音響効果：倉橋静男 　　録音：阿部幸男 　　録音助手：亀本美佳 　　録音スタジオ：アバコクリエイティブスタジオ 　　音響制作：アーツプロ 　　編集：尾形治敏、伊藤勇喜子 　　現像：IMAGICA 　　タイトル・リスワーク：マキ・プロ 　　フィルム：日本コダック 　　演出助手：うえだしげる 　　制作プロデューサー：吉本聡 　　政策デスク：中川真紀 　　制作進行：小山雅弘、畠山茂 　　制作管理：小野達矢 　　宣伝担当：藤沢正博、武市光香 　　監修：川尻善昭 　　監督：佐藤雄三 　　アニメーション制作：マッドハウス 　　制作：東映ビデオ、フィルムリンク・インターナショナル、グッドヒルヴィジョン

分隔在两个世界的爱力克兄弟二人，使用各自的手段尝试着兄弟再会。 　　哥哥爱德华穿过“门”来到真实世界。公元1923年的德国慕尼黑，一场世界大战即将到来。无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 　　而暗地中，慕尼黑的一个神秘组织开始了寻找理想国“香巴拉”的仪式，连接炼金术世界与现实世界的“门”被打开了。 　　兄弟二人的命运与两个世界的危机交织在一起，爱力克兄弟要面对前所未有的挑战。

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验…… 　　本片为福音战士新剧场版四部曲第二部。